Клонирование, очистка и первичная характеристика рекомбинантной
ДАБ-ацетилтрансферазы. Клонирование и экспрессия генa ectА из M. marinaСтраница 1
Для конструирования продуцента ДАБ-ацетилтрансферазы ген ectА клонировали в экспрессирующий вектор pET28, определяющий синтез рекомбинантного белка с дополнительными 6 His на С-конце. Полученной плазмидой pETectA трансформировали E. coli BL21(DE3). В растворимой фракции лизата клеток E. сoli, после индукции ИПТГ, методом денатурирующего гель-электрофореза в присутствии SDS обнаружен белок с электрофоретической подвижностью, соответствующей молекулярной массе около 20 кДа (Рис. 17), которая согласуется c рассчитанной на основе аминокислотной последовательности (18.88 кДа).
Рис. 17. Электрофорез в 12.5%-ном SDS-ПААГ: 1 - маркерные белки; 2 – ДАБ-ацетилтрансфераза
В контрольных клетках E. coli (выращенных без индуктора) соответствующая белковая полоса отсутствовала. Очистку белка проводили методом аффинной хроматографии на Ni2+-NTA агарозе. В результате был получен гомогенный препарат EctA-His6-tag (Рис. 16). Электрофоретическая подвижность белка EctA из M. marina соответствует молекулярной массе около 20 кДа, которая согласуется c теоретически рассчитанным значением 20.0 кДа. При гель-фильтрации полученного препарата на Ultrogel AcA54 пик активности белков соответствовал молекулярной массе 40 кДа, что соответствует молекулярной массе гомодимерной формы данного фермента.
Физико-химические свойства ДАБ-ацетилтрансферазы. Температурный оптимум фермента составил +15°C (Рис. 18). Фермент активен в диапазоне рН от 7 до 9 с оптимумом при рН 8 (Рис. 19).
Рис.18 Зависимость активности ДАБ-ацетилтрансферазы от температуры.
Рис.19 Зависимость активности ДАБ-ацетилтрансферазы от pH.
Ранее ДАБ-ацетилтрансфераза была частично охарактеризована у H. elongata (Ono et al., 1999), Mm. alcaliphilum 20Z (Reshetnikov et al., 2006), M. alcalica и M. talassica (Mustakhimov et al., 2008). Необычно низкий температурный оптимум – около 15ºС является главной отличительной особенностью этого фермета у M. marina по сравнению с ДАБ-ацетилтрнсферазами из выделенными из Mm. alcaliphilum 20Z, M. thalassica и M. alcalica. Общим свойством ферментов из вышеперечисленных метилотрофов и M. marina является близкая электофоретическая подвижность, соответствующая ~20 кДа (табл. 6). Однако, по некоторым свойствам ДАБ-ацетилтрансфераза из M. marina отличается от ферментов из Mm. alcaliphilum 20Z, M. alcalica и M. thalassica, имеющих максимальные активности при температурах, соответственно, 20, 35, 30°C и рН 9.5, 9.0 и 8.5.
Таблица 6. Свойства ДАБ-ацетилтрансфераз галофильных бактерий.
Свойства |
M. thalassica |
M. alcalica |
M. alcaliphilum |
M. marina |
Оптимум pH |
8.5 |
9.5 |
9.5 |
8 |
Оптимум темпратуры, ºC |
30-35 |
30-35 |
20 |
15 |
Молекулярная масса (SDS-ПААГ электрофорез) |
20 kДa |
20 kДa |
20 кДa |
20 кДa |
Молекулярная масса (гель фильтрация) |
40 kДa |
40 kДa |
40 кДa |
40 кДa |
Kм (ДАБ) |
0.365 мM |
0.375 мM |
0.465 мM | |
Kм (ацетил-КоА) |
76 мкM |
30 мкM |
36.7 мкM | |
Ингибиторы (1 мM) |
Zn2+ Cd2+ Cu2+ |
Zn2+ Cd2+ Cu2+ |
Zn 2+ Cd 2+ | |
Оптимальная концентрация KCl, М |
0 |
0 |
0.25 М | |
Оптимальная концентрация NaCl, М |
0 |
0 |
0.1-0.2 М |
0.1 М |
Стабильность |
Стабилен * |
Стабилен* |
Стабилен * |
Нестабилен * |
Также смотрите:
Способы общения
Издаваемые косулями звуковые сигналы являются основными средствами их внутривидовой коммуникации. Большую роль в общении животных, особенно в период их коллективного существования, играют сигналы, рассчитанные на зрительное восприятие: особые позы, движения, вид распу ...
Характеристика водорастворимых витаминов
Тиамин (витамин В,)
Рибофлавин (витамин В2)
Пантотеновая кислота (витамин В3)
Никотиновая кислота (витамин В5, РР)
Пиридоксин (витамин В6)
Цианкобаламин (витамин В12)
Пангамовая кислота (витамин В15)
Аскорбиновая кислота (витамин С)
Цитрин (витамин Р)
Биотин ...
Корневая и прикорневая микрофлора, её состав и влияние на
растения
Нормальная микрофлора растений представлена ризосферными и эпифитными микробами. Зона почвы, находящаяся в контакте с корневой системой растений, носит название ризосферы , а микроорганизмы, развивающиеся в данной зоне, называются ризосферными. Условно различают два т ...